Din punct de vedere al zonării interne suprafaţa Parcului Natural Vânători Neamţ se împarte în trei zone:
- zona de protecţie integrală
- zona tampon- zona de management durabil
- zona de dezvoltare durabilă
Zona de protecţie integrală
Zona de conservare integrală are o suprafaţă totală de 615,5 hectare şi se compune din patru trupuri, după cum urmează:
- Zona de aclimatizare a zimbrului
- Zona Rezervaţiei de Stejari Dumbrava
- Zona Agapia-Văratec
- Zona de reintroducere a zimbrului
Zona tampon – zona de management durabil
În baza OU 57/2007 zonele-tampon, denumite în parcurile naturale zone de management durabil, nu se includ în zonele cu protecţie integrală, strictă sau de dezvoltare durabilă a activităţilor umane şi fac trecerea între zonele cu protecţie integrală şi cele de dezvoltare durabilă.
Zona tampon se întinde pe o suprafaţă de 27785,3 ha şi reprezintă suprafaţa parcului, cu excepţia zonelor de protecţie integrală ( 615,5 ha) şi zonele de dezvoltare durabilă( 2230,2 ha).
Zone de dezvoltare durabilă
Zonele de dezvoltare durabilă a activităţilor umane sunt zonele în care se permit activităţi de investiţii/dezvoltare, cu prioritate cele de interes turistic, dar cu respectarea principiului de utilizare durabilă a resurselor naturale şi de prevenire a oricăror efecte negative semnificative asupra biodiversităţii. Zona de dezvoltare durabilă însumează o suprafaţă de 2218,58 ha dupa cum urmeaza:
- Zona de dezvoltare durabilă – Cetatea Neamțului
- Zona de dezvoltare durabilă – Schitul Sfânta Cruce
- Zona de dezvoltare durabilă – Schitul Icoana Nouă
- Zona de dezvoltare durabilă – Schitul Icoana Veche
- Zona de dezvoltare durabilă – Schitul Pocrov
- Zona de dezvoltare durabilă – Mănăstirea Neamţ -Vovidenia
- Zona de dezvoltare durabilă – Schitul Branişte – Leghin
- Zona de dezvoltare durabilă – Mănăstirea Secu
- Zona de dezvoltare durabilă – Schitul Piciorul Crucii
- Zona de dezvoltare durabilă – Mănăstirea Agapia Veche
- Zona de dezvoltare durabilă – Mănăstirea Agapia
- Zona de dezvoltare durabilă – Schitul Sihla
- Zona de dezvoltare durabilă – Schitul Daniil Sihastru
- Zona de dezvoltare durabilă – Mănăstirea Sihăstria
- Zona de dezvoltare durabilă Magazia – Cracăul Negru – Mitocul Bălan
- Zona de dezvoltare durabilă – Schitul Bouleţul Mic
- Zona de dezvoltare durabilă – Bouleţ
- Zona de dezvoltare durabilă – Pepinieră Dumbrava
- Zona de dezvoltare durabilă – Monumentul Eroilor